以前のこの投稿
Zabbixの設定のみをバックアップする (Zabbix 3.0)
からいろいろ修正、Zabbix 3.4への対応なども含めてCLIツールをリリースしました。
GitHubなどでも同様のツールは見かけますが、リストアまで含めて対応しているものであったり、3.0よりも新しいバージョンに対応した物はほとんど見かけなかったので。
lf-uraku-yuki/zabbix_db_config_backup: Zabbix DB Config Only Backup Tool
https://github.com/lf-uraku-yuki/zabbix_db_config_backup
これをcronで定期的に叩いて差分バックアップを取り続ける事で、任意の時点への設定巻き戻しが可能になります。巻き戻した時点までの監視ログは、整合性確保の為に消失しますのでご注意ください。
また、無保証ソフトウェアとなりますのでその点も何卒。